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FASTQ格式文件无损压缩的方法

743   编辑：管理员   来源：中冶有色技术网  
2023-03-19 08:58:03
本发明属于生物信息领域，涉及一种DNA测序数据的标准存储方式FASTQ格式文件无损压缩的方法。首先，将原FASTQ文件按序列进行提取，第三行丢弃。然后，将提取的序列按照行重新生成新的文件，分别为保存第一行的序列标志文件、保存第二行的序列数据文件和保存第四行的质量评分文件。其次，对第二步生成的三个文件分别利用进行压缩处理：对序列数据文件进行压缩、对质量评分文件进行压缩、将序列标志文件进行处理之后再进行压缩。最后，对第三步生成的压缩文件，用tar将其压缩为一个文件，并且删除中间过程文件。通过本发明方法可以对下一代测序技术产生的海量DNA测序数据进行经济性存储和快速传输。
声明：
“FASTQ格式文件无损压缩的方法” 该技术专利(论文)所有权利归属于技术(论文)所有人。仅供学习研究，如用于商业用途，请联系该技术所有人。
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