本发明提供了用于检测样品中存在的一种或多种核酸靶物的组合物、仪器和方法。本发明的方法包括:使用2种或更多种寡核苷酸探针,所述探针彼此紧密靠近地可逆地结合靶核酸,并具有互补的反应性连接部分。当这样的探针已经以适当取向结合靶物时,它们能够发生自发的化学连接反应,该反应产生连接的寡核苷酸产物。在一个方面,所述连接产物具有与特定靶物有关的可变长度。在化学连接以后,通过毛细管电泳或微阵列分析,可以放大和检测探针。
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