本申请涉及革兰氏阳性细菌全细胞分析的方法。所述方法能确定样品(例如,临床样品)是否包含一种或多种选定的革兰氏阳性细菌,以及确定例如所述样品中所述选定的革兰氏阳性细菌是否都不具有所选的目的性状、或部分细菌具有所选的目的性状或所有细菌都具有所选的目的性状,或者所述样品中可能存在的其它细菌具有所选的目的性状。在一些实施方案中,所述方法可用于确定所述样品中的抗甲氧苯青霉素(选定的性状)的金黄色葡萄球菌(选定的革兰氏阳性细菌)、凝固酶阴性葡萄球菌(另一种选定的革兰氏阳性细菌)和/或甲氧苯青霉素敏感性金黄色葡萄球菌(MSSA)。例如,可以通过原位杂交(ISH)、荧光原位杂交(FISH)、免疫细胞化学(ICC)或以上两种或更多种的任意组合进行全细胞分析。
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