本发明公开了一种海量DNA测序数据无损快速压缩平台,涉及DNA测序数据压缩平台领域,该平台将输入FASTQ数据分割成元数据、碱基和质量分数三个数据流,并根据它们自身特点分别独立地压缩:去除元数据流中的重复片段并使用LZMA算法进行压缩;对质量分数流使用游程编码和算术编码压缩;使用匹配工具BWA将短读与参考基因组比对,提取比对结果中的碱基流表达信息并使用LZMA算法、游程编码、算术编码进行压缩。该平台针对DNA序列本身具有的冗余性进行压缩,减少了压缩所需的存储空间。
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