某些碳菁(carbocyanine)化合物靶向线粒体,且可用于根除癌症干细胞(CSC)。例如,MitoTracker Deep Red(MTDR)是一种无毒、碳菁基远红外荧光探针,通常用于对活细胞中的线粒体进行化学标记和可视化。MTDR抑制MCF7细胞、MDA‑MB‑231细胞和MDA‑MB‑468细胞的3D乳腺球形成,IC‑50为50nM至100nM。此外,在500nM的水平,MTDR在测试的所有三种乳腺癌细胞系中几乎完全抑制了线粒体耗氧率和ATP产生。纳摩尔浓度的MTDR可用于通过选择性干扰线粒体代谢特异性靶向和根除CSC。描述了具有抗CSC活性的其他碳菁化合物。
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