本发明提供一种单碱基分辨率DNA标记和鉴定的方法,该方法基于DNA腺嘌呤的N6‑烯丙基或胞嘧啶的N4‑烯丙基标记并化学处理诱导其在DNA复制过程中发生碱基突变,然后通过核酸测序手段识别突变位点,进而得到6aA或4aC位点。本发明方法可用于标记新生DNA,也可用于鉴定6mA或4mC甲基转移酶修饰位点,进一步地能够在细胞内部通过细胞自身代谢过程对6mA或4mC位点进行特异性标记,该标记不但能够原位替换细胞内的6mA或4mC位点,并且能够借助突变测序的手段进行定位。本发明方法与现有DNA标记和鉴定技术相比,由于突变位点可以精确到单碱基的分辨率,提升了目前普遍采用的基于抗体免疫沉淀与大规模平行测序方法检测修饰位点的精度,是一个直接的单碱基鉴定方法。
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