本发明属于生化分析技术领域,具体涉及一种从福尔马林固定石蜡包埋样本提取蛋白质的方法,包括以下步骤:将福尔马林固定石蜡包埋样本在弱碱性pH值下在90‑100℃的温度下加热处理一段时间;向所得的加热处理液加入蛋白酶,在蛋白酶的适宜作用温度范围下酶解处理一段时间;将所得的酶解液进行离心,得到包含蛋白质的酶解肽段的上清液。本发明的方法通过加热处理同时实现蛋白质的解交联和变性,可以不添加化学变性剂使蛋白质变性,可以省去校正pH以去除化学变性剂的操作,并且可以省去后续的沉淀和除盐操作,有利于简化实验操作,尤其是批量样品操作,减少所需的肽段样品的损失。
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