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利用计算机模拟蛋白质相互作用的方法

612   编辑:管理员   来源:中冶有色技术网  
2023-03-19 07:33:29
本发明公开了一种利用计算机模拟蛋白质相互作用的方法。该方法利用NAMD_2.6_LINUX-I686计算软件和VMD-1.8.5分析软件在PC机上进行分子动力学模拟,首先将PDB数据库的蛋白质结构制成适当的研究体系,然后对该体系进行能量最小化处理,将体系加热到设定温度后,再对体系进行多步平衡处理,接着对体系实施分子动力学模拟,最后研究蛋白质在设定条件下所有原子的运动轨迹、构象变化和变化过程中起关键作用的氨基酸残基。该方法不需借助于大型计算机和高性能计算中心,设备要求低,CPU利用率高,所用机时短并且结果准确可靠,便于在与分子识别和蛋白质动力学行为相关的生命科学和物理化学以及医药领域广泛应用。
声明:
“利用计算机模拟蛋白质相互作用的方法” 该技术专利(论文)所有权利归属于技术(论文)所有人。仅供学习研究,如用于商业用途,请联系该技术所有人。
我是此专利(论文)的发明人(作者)
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