本发明公开了一种过氧化物酶催化的细胞表面蛋白质标记方法。细胞外引入外源的过氧化物酶催化化学探针产生活性强、寿命短的自由基对暴露在细胞质膜外侧的蛋白质基团进行选择性共价标记。反应一段时间后,加入封闭缓冲液终止标记反应。接着,利用化学探针上的捕获基团对标记的蛋白质进行蛋白质组学分析。化学探针自由基可以与相邻蛋白质上氨基酸,主要与酪氨酸、色氨酸、组氨酸和半胱氨酸等电子密度较高的氨基酸中的一种或二种以上发生共价连接。此标记策略操作简单,选择性好,反应速率快,不破坏细胞表面蛋白质的糖型,可以应用于细胞表面蛋白质组(或质膜蛋白质组)及其动态变化分析,也可以应用于细胞表面蛋白质‑蛋白质相互作用以及细胞‑细胞间相互作用等的研究。
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