本发明涉及BPDE加合靶蛋白的鉴定领域,具体是一种BPDE加合靶蛋白的鉴定方法。该方法包括1)收集细胞及提取蛋白;2)细胞裂解物的染毒及蛋白酶消化;3)质谱前样品准备;4)LC‑MS/MS分析:取肽段进行色谱分离;肽段分离后用质谱仪进行DDA质谱分析;5)质谱数据库检索:下载蛋白质数据库,根据质谱分析数据获得BPDE靶蛋白。该方法可直接鉴定蛋白裂解物中可与BPDE加合的靶蛋白,并且在检测过程中不需要对小分子进行化学修饰、不会影响到小分子原有的活性、不受任何细胞和组织类型限制、不要求使用纯蛋白质,甚至可以使用全细胞裂解物,可广泛应用于小分子加合靶蛋白的鉴定。
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