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LncRNA和环境因素关联关系的高效预测方法

895   编辑：管理员   来源：中冶有色技术网  
2023-03-19 07:29:08
本发明公开一种LncRNA和环境因素关联关系的高效预测方法，主要包括以下步骤：1、下载数据集，得到LncRNA和环境因素(EF)的列表，和二者关联关系的关联矩阵A；然后分别计算出LncRNA和EF的高斯相互作用属性核相似矩阵KL、KE。2、计算EF之间的化学结构相似性矩阵E。3、将KL进行逻辑斯蒂函数转换，得到相似矩阵SL；且利用E和KE构建EF的相似矩阵SE。4、融合A、SL和SE构建一个全局异构网络G；利用重启随机游走计算扩散特征，并使用奇异值分解降维。5、计算lncRNA‑EF对的Hetesim得分。6、结合扩散特征和HeteSim得分得到特征数据集并用于训练梯度提升树分类器去预测LncRNA‑EF的关联关系。7、使用10折交叉验证方法对提出的方法进行验证。应用本发明预测LncRNA和EF关联关系的精度高。
声明：
“LncRNA和环境因素关联关系的高效预测方法” 该技术专利(论文)所有权利归属于技术(论文)所有人。仅供学习研究，如用于商业用途，请联系该技术所有人。
我是此专利(论文)的发明人(作者)
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