本发明公开了一种蛋白质组学中肽段的肽段定量效率预测方法,其步骤包括:1)筛选出高可信蛋白,将高可信蛋白的鉴定肽段作为高可信肽段;2)计算所述高可信肽段的物理化学性质和肽段定量效率;其中,所述肽段定量效率为肽段的质谱信号强度对肽段的真实量的反应程度;3)基于高可信肽段的物理化学性质和肽段定量效率,构建预测肽段定量效率模型的训练集;然后利用该训练集训练得到肽段定量效率预测模型;4)利用所述肽段定量效率预测模型预测鉴定蛋白的各鉴定肽段的肽段定量效率。本发明的方法使用高可信肽段构建训练集,在线训练肽段定量效率,排除了实验操作,实验仪器等引起的误差。
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