本发明公开了一种药物分子特征属性的预测方法及预测装置。所述预测方法包括:构建原始药物分子属性数据集;对原始药物分子属性数据集进行预处理,获得训练样本,训练样本包括分子指纹、分子图结构信息和分子特征属性值;以分子指纹和分子图结构信息作为输入,以分子特征属性作为输出,建立一个多输入预测模型,利用训练样本对预先构建的多输入预测模型进行训练,得到最终预测模型;将新获取的分子属性数据输入到最终预测模型,得到分子特征属性预测值。该训练样本充分考虑了药物小分子的空间几何特征和物理化学特征,该最终预测模型能有效地预测分子特征属性值,且具有较高的准确率。
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