本发明提供一种拉曼光谱法生物分子测序方法,包括步骤:I、提供纳米孔装置,包括柔性基底纳米孔结构,所述柔性基底纳米孔结构包括纳米孔、金属层,以缩小所述纳米孔尺寸至1~100nm;II、所述生物分子向所述纳米孔移动,激光拉曼显微镜向所述纳米孔发射激光,所述生物分子通过所述纳米孔时,产生拉曼光谱信号;III、光谱测量装置测量拉曼光谱信号得出测量数据;IV、数据采集分析装置分析系所述测量数据并输出结果。本发明使用表面增强拉曼光谱的检测策略,具有技术效果可实现亚纳米空间分辨率的检测;提供分子特异性指纹信息的振动光谱,各碱基光谱信号不重叠,具有优异的区分度和化学灵敏度。
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