本发明提供一种活性蛋白质与小分子相互作用的质谱检测方法,该方法在保持活性状态下对蛋白质进行体外共价化学标记,通过蛋白质上特定氨基酸位点在与小分子相互作用前后标记效率的差异情况,判断小分子与蛋白质相互作用的位点和强度。本发明能对蛋白质抑制剂候选小分子进行高通量筛选和对特定小分子的潜在蛋白质靶点进行规模化鉴定分析。通过对儿茶酚甲基转移化酶(Catechol‑O‑methyltransferase,COMT)‑小分子相互作用和复杂体系生物体系中ATP结合蛋白质的规模化鉴定分析,证明了该方法的准确性和高效性。
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