本发明涉及一种用于化学交联质谱解析蛋白‑蛋白相互作用,实现蛋白质复合物交联信息深度覆盖的分析方法,该方法通过在样品预处理过程中使用与胰蛋白酶不同的一种或多种限制性内切酶分别与胰蛋白酶进行联合酶切的方式,实现多种酶解产物对蛋白质复合物交联信息的深度覆盖。该方法能有效地用于解析单一蛋白质复合物,将交联蛋白酶解成适合质谱解析的肽段长度,得到更全面、丰富的蛋白质相互作用信息。在蛋白质复合物结构解析领域有着广阔的应用前景。
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