本发明公开了一种用于分析G蛋白偶联受体与配体相互作用的方法和系统。该方法包括:接收用户输入的受体名称或晶体结构编号;收集受体相关晶体结构信息,并存入对应数据库;清理PDB文件并通过几何和物理化学特性进行计算分析,获得反映受体和配体相互作用的分析结果;对所述分析结果以2D可视化和3D可视化的形式显示相关数据。本发明可提供多种相互作用的分析,根据受体的多种结构进行3D整体结构可视化展示,以及2D可视化展示,从而有利于结构生物学研究、药效团研究、虚拟筛选等各个领域的深入研究。
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