本发明涉及一种整体蛋白质定量分析方法,首先将两组不同生理或病理条件的整体蛋白质分别作为控制组与疾病组,并分别对可能存在的二硫键进行还原,同时对巯基进行烷基化保护;然后对两组烷基化的蛋白质的氨基酸特定官能团进行全同重化学共价标记;同重标记后两组蛋白质按等比例混合进行高分辨质谱和串级质谱分析得到一个数据组;最后对数据组进行定性、定量数据库搜索,得到蛋白质的ID及疾病组每一个蛋白质相对于控制组的相对比例,即疾病条件下所有蛋白的上调或下调情况,上调或下调倍数最大的蛋白即为与该疾病发生、发展相关的蛋白。与现有技术相比,本发明方法标记效率高,准确度高,适用于整体蛋白质基于高分辨串级质谱的定量分析。
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