本发明涉及一种不同生理或病理条件下整体蛋白质的定量分析方法,首先将两组不同生理或病理条件的整体蛋白分别作为控制组与疾病组,进行还原和烷基化;对两组烷基化的蛋白序列中赖氨酸残基上的ε-氨基进行化学保护;将经化学保护后的两组蛋白质的N端氨基进行同重标记;同重标记后两组蛋白按等比例混合进行高分辨质谱和串级质谱分析得到一个数据组;对数据组进行定性、定量数据库搜索,得到蛋白质的ID及疾病组每一个蛋白质相对于控制组的相对比例,即疾病条件下所有蛋白的上调或下调情况。与现有技术相比,本发明方法标记效率高,准确度高,适用于整体蛋白质基于高分辨串级质谱的定量分析。
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