提供了一种检测RNA目标位点X的化学修饰的方法,其包括:(1)获得RNA样品,在RNA样品中选择包含RNA目标位点X的目标RNA区段;(2)SELECT步骤;(3)PCR扩增步骤;(4)将所述PCR阈值循环数与PCR阈值循环数参比值比较,或者将所述PCR扩增产物量与PCR扩增产物量参比值比较,以确定目标RNA位点X是否存在目标化学修饰。还提供了一种鉴定RNA修饰酶或RNA去修饰酶底物靶位点的方法和一种用于定量转录本中RNA修饰率的方法。
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