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针对FASTQ数据的多线程快速存储无损压缩方法及其系统

709   编辑：管理员   来源：中冶有色技术网  
2023-03-19 08:58:02
本发明提供一种针对FASTQ数据的多线程快速存储无损压缩方法，应用于DNA序列的压缩，其中，所述方法包括：数据分类步骤：输入原始FASTQ数据，并将所述原始FASTQ数据的短读分成元数据、质量分数和碱基序列三个数据流；数据压缩步骤：针对元数据，利用增量编码方式进行检测并消除元数据的冗余信息；针对质量分数，利用比特级别的PPM预测模型和算术编码进行压缩；针对碱基序列，利用固定阶位的改良型算术编码进行压缩；数据输出步骤：将不同数据流的压缩结果进行归档合并，输出经过压缩后的最终数据。本发明还提供一种针对FASTQ数据的多线程快速存储无损压缩系统。本发明提供的技术方案能提高压缩效率和压缩速度。
声明：
“针对FASTQ数据的多线程快速存储无损压缩方法及其系统” 该技术专利(论文)所有权利归属于技术(论文)所有人。仅供学习研究，如用于商业用途，请联系该技术所有人。
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