本发明公开了一种基于投影邻域非负矩阵分解的lncRNA蛋白质关联预测方法,首先,根据lncRNA序列、lncRNA表达谱数据、蛋白质序列、蛋白质的GO功能注释数据以及lncRNA和蛋白质的交互网络,计算得到多种lncRNA特征、蛋白质特征、lncRNA相似矩阵和蛋白质相似矩阵。其次,将多种lncRNA相似网络进行融合得到整合的lncRNA相似网络,将多种蛋白质相似网络进行融合得到整合的蛋白质相似网络。最后,结合整合的lncRNA(蛋白质)相似网络和多种lncRNA(蛋白质)特征,提出了一种特征投影的邻域非负矩阵分解算法来预测lncRNA蛋白质的潜在交互。本发明不仅能准确的预测新的lncRNA蛋白质交互,同时还可以预测没有关联任何lncRNA(蛋白质)的新的蛋白质(lncRNA),有效的避免了生物化学实验导致的高人力物力消耗。
声明:
“基于投影邻域非负矩阵分解的lncRNA蛋白质关联预测方法” 该技术专利(论文)所有权利归属于技术(论文)所有人。仅供学习研究,如用于商业用途,请联系该技术所有人。
我是此专利(论文)的发明人(作者)