本发明公开了一种基于小波变换支持向量机对蛋白质功能与结构的在线预报方法,该方法包括如下步骤:1.建立蛋白质序列数据集的训练样本集;2.利用氨基酸的物理化学性质将蛋白质氨基酸序列转化为数值序列;3.利用小波变换进行特征提取;4.支持向量机训练生成的蛋白质特征数据集;5.需要预报的蛋白质序列的读入、数据转换及蛋白质结构与功能的在线预测。该方法能实现对未知蛋白质的家族及功能的预测,验证结果表明对G蛋白偶联受体、酶蛋白、蛋白质亚细胞结构、蛋白质二级结构均有好的预测准确率。在线预测时,用户只需在预报网页界面提供要预报的蛋白质序列,对其数据进行转换后利用小波变换对其进行特征提取,完成支持向量机的训练和目标的预报,输出预报结果。
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