本发明提出一种从复杂组分物质如中药和组合化学分子及其混合物中高通量筛选、捕获和分离目标分子的新方法。该方法首先针对特定目标的双链核酸结合蛋白特别是序列特异性DNA结合蛋白,如转录因子如NF-κB、核受体等,在固相支持物表面制备一种双链核酸微阵列
芯片,使其双链核酸探针上嵌合双链核酸结合蛋白的结合位点,用以高通量测定量核酸结合蛋白与双链核酸微阵列芯片上各结合位点的亲合性,建立序列核酸结合蛋白与其芯片上各核酸靶点的结合亲合性标准参数体系;再用双链核酸微阵列芯片与复杂组分物质如中药和组合化学分子及其混合物反应,反应后通过检测核酸结合蛋白与其芯片上各核酸靶点的结合亲合性变化,筛选出那些与标准参数体系比较结合亲合性发生改变的核酸靶点;将其作为核酸亲合介质连接到层析柱表面,制备特异性核酸探针层析柱;再将复杂组分物质如中药和组合化学分子及其混合物灌柱,用核酸探针捕获复杂组分物质中与核酸探针特异结合的有效分子;最后经洗脱收获与核酸探针结合的有效分子,进行其化学性质、分子生物学基础及药理学研究,开发成为核酸结合蛋白的核酸靶点特异性候选药物。该发明的技术及思想体系,在基础分子生物学研究,特别是序列特异性DNA结合蛋白(转录因子)基因表达调控,以及生物医学研究,如序列特异性DNA结合蛋白(转录因子)相关疾病药物作用机理研究和药物性分子筛选中有广泛而重要的应用价值。
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