本发明提供了一种与黄瓜果实β胡萝卜素含量相关的SNP标记及其应用,其位于编码黄瓜Csa3G183920蛋白的基因序列第770bp处,此处碱基为A的黄瓜果实β胡萝卜素含量高,果肉颜色呈橙黄色;此处碱基为C的黄瓜β胡萝卜素含量低,果肉颜色为白色。本发明利用变异组学和群体遗传学等方法筛选到与黄瓜果实β胡萝卜素含量及果肉颜色性状相关的SNP标记,并通过生物化学方法阐明了Csa3G183920通过降解β胡萝卜素调控果实颜色的分子机制。通过测序或dCAPS等方法检测待测黄瓜的基因型,根据基因型即可判断黄瓜果实β胡萝卜素含量高低以及果肉颜色,从而加快高营养黄瓜品种的培育进程。
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