基于多标记学习的抗菌肽活性预测方法通过提取肽序列对应的氨基酸成分,然后根据物理化学属性编码获取对应的矩特征,共同构成肽序列的特征向量。每条肽序列的特征向量是由两部分构成,一是氨基酸成分,二是基于物理化学属性编码提取的矩特征。采用最小二乘的多标记学习算法计算最小化变换矩阵W,则能够通过变换矩阵W得出待测样本的各标记输出,根据各标记输出获取预测类标签向量集合。根据类标签向量集合快速准确预测抗菌肽序列的活性。因此,能够获取肽序列各个角度的形状特定,从而能够快速、准确、自动标注抗菌肽活性。
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