本发明公开了分子化学性质预测技术领域的基于图神经网络的人体口服生物利用度预测方法,包括初始原子、化学键特征抽取模块和图神经网络模块;初始原子、化学键特征抽取模块,图神经网络需要将分子结构信息转化为分子图,需要定义原子和化学键的初始特征以供图神经网络使用,利用原子结构信息,构建原子邻接矩阵代表分子的拓扑结构;图神经网络模块,图神经网络的前向传播包含两个步骤,包括消息传递和读出,消息传递需要进行多次以生成好的原子、化学键的隐藏表示,能够通过使用图神经网络,避免分子描述符的抽取,减少工作量,使用化学键消息吸收机制,使得化学键辅助模型学习到更好的分子表示,提高图神经网络的解释性。
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