本发明提供了一种用MALDI-TOT-TOF(基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间)质谱对蛋白质N端序列进行从头测序的方法和试剂盒。该方法涉及蛋白质的分离、还原烷基化、蛋白质的化学修饰、酶切肽段的质谱分析、蛋白质N端肽段的质谱识别与从头测序。该方法对胶内蛋白质的赖氨酸进行胍基化,选择性地将TMPP-Ac修饰在蛋白质N端氨基上;并通过加入终止试剂和洗涤。该方法所得的蛋白质N端氨基修饰物不受过量的试剂和相应的副产物的影响,与质谱技术相容。该方法可对蛋白质的N端肽进行富集,结合反相液相色谱和生物质谱技术,既容易确定蛋白质的N端肽段,又可以很方便地进行从头测序。
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