本发明提供了测定模板核酸的核酸序列的方法,该方法无需预知模板核酸中存在的核酸序列。该方法基于关于片段质量、任意一种核苷酸及其组合的质量、核苷酸切割物(酶或化学切割物)的序列特异性的组合信息确定核酸片段的序列。该方法允许从头检测靶核酸内的序列,而无需预知任何序列信息。该方法被称为通过片段化进行的部分测序(PSBF),即通过将靶序列片段化为质量或长度与已知序列独特相关的寡或多核苷酸而实现目的。这些序列的身份仅通过所用的特异性片段化方法测定,并总是不依赖于靶序列。PSBF可通过应用电泳、质谱或其它可被用于区分被切核酸序列片段大小的任意方法实现。
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