本文提出了用于进行测序的系统和方法,所述测序包含荧光原位测序。在一个实施例中,共焦时间延迟积分(TDI)线扫描成像系统可以包含在图像传感器前方的各种针孔和/或狭缝孔径机构。所述系统还可以包含在基底上具有聚焦条带的结构,其与待成像的组织样本接触。替代地,这些条带可以被切割成组织样本。所述系统还可以包含配置和方法,其中在流动池的组装期间将组织样本放置在流动池的反应室内,然后对组织样本进行化学操作。所述流动池可以使用开放式容器对组织样本进行化学操作。
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