本发明涉及一种使用优化的低聚物调度用于质谱生物聚合物分析的方法。一种用于检测已知生物聚合物分子列表的方法,该方法包括:对于每种生物聚合物,计算预测由化学处理产生的对应的低聚物分子列表;对于每种低聚物分子,计算对应的预测的色谱洗脱时间段;对于每种生物聚合物分子,指定一种或多种选择的低聚物分子进行检测,其中该选择是使用从这些预测洗脱时间确定的加权选择概率进行的;调度检测系统的多个低聚物检测事件,其中每个低聚物检测事件对应于这些预测的洗脱时间段中的一个对应的时间段;进行该样品的化学反应或处理以产生经处理的样品;将该经处理的样品引入一个色谱系统中;将任何洗脱低聚物引入该检测系统中;并且运行该检测系统以便根据这些经调度的检测事件搜索这些选择的低聚物分子中的每一种。
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