本发明公开了一种Cy系列荧光素的合成方法以及在DNA测序中的应用,所述方法包括:A、将反应物与反应物YCH2(CH2)4COOH或者YR回流,得到反应中间体和B、将步骤A所得与反应,生成然后直接加入一锅法生成目标产物;所述各结构式中,Y=Cl,Br,I;R=Me,乙基,丙基;X=O,CH(CH3)2;R1‑R4任选H或者SO3‑、或者R1,R2与苯环共同构成萘环以及衍生物、或者R3,R4与苯环共同构成萘环以及衍生物;n=1,3,5。该方法通过一锅法得到所需不对称结构荧光素,反应选择性好,容易分离纯化,且所需实验条件简单,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。
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