本申请公开了一种药物‑蛋白质相互作用预测方法及系统,其中,方法包括:收集药物‑蛋白质相互作用预测的数据集;对数据集进行预处理,得到处理后数据;基于处理后数据,进行蛋白质序列编码,提取蛋白质特征;基于蛋白特征,同时对药物和蛋白质的分子机制进行编码,得到第一编码结果;基于处理后数据,将药物和蛋白质的临床信息编码在一起,得到第二编码结果;根据第一编码结果和第二编码结果,计算药物‑蛋白质对的相互作用概率。本申请同时考虑了药物和蛋白质的化学属性、分子机制和临床功能;将药物和蛋白质的原始特征投影到了共同的嵌入子空间中;通过分析药物和蛋白质的特征的一致性,探究药物与蛋白质的作用机制。
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