本发明描述了识别例如核酸的聚合物分子的系统和方法。该方法涉及集中由通道隔开的一对纳米电极上的偏压,并在感兴趣的分子在通道中时用调制波形调制偏压,所述偏压对应于感兴趣的分子的任意两个内部能级之间的能量差。表征感兴趣的分子的电信号从纳米电极之间的隧道电流导出,并且表征电信号被与化学上已知分子的已知信号值进行比较以识别该感兴趣的分子。多个纳米电极对也可用来更可靠地识别单个分子或多个分子。
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