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基于高通量测序鉴定小麦赤霉和茎基腐病菌种、毒素类型和多菌灵抗性的检测方法

879   编辑：管理员   来源：中冶有色技术网  
2023-03-19 06:59:01
本发明涉及农作物病害检测、鉴定及防治技术领域，公开了一种基于高通量测序鉴定小麦赤霉和茎基腐病菌种、毒素类型和多菌灵抗性的检测方法。包括以下步骤：S1：扩增小麦赤霉病菌或茎基腐病菌目的基因片段；S2：混合扩增产物，在Illumina平台上进行高通量双端测序；S3：采用Python脚本一步自动化完成数据拆分、序列比对、比对文件转换排序、变异检测和基因分析。同时，脚本自动统计分型结果，根据特异性SNP位点鉴定引起赤霉病菌和茎基腐病菌的11个种镰孢菌、3种毒素化学型以及对4种杀菌剂多菌灵的抗药突变类型。开发的特异性barcode标签，可以在1个扩增子文库中特异性标记384个菌株。本方法适合大量病原菌的高通量检测，能够为区域性病害防控策略的制定提供重要依据。
声明：
“基于高通量测序鉴定小麦赤霉和茎基腐病菌种、毒素类型和多菌灵抗性的检测方法” 该技术专利(论文)所有权利归属于技术(论文)所有人。仅供学习研究，如用于商业用途，请联系该技术所有人。
我是此专利(论文)的发明人(作者)
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